Исследователи представили первый нейросетевой инструмент для создания полностью искусственных систем редактирования генома CRISPR-Cas9. Одну из них успешно испытали на человеческих клетках.
Ученые провели систематический сбор данных из 26,2 трлн пар оснований микробных геномов и метагеномов из разных родов и биомов. После этого языковую модель на основе ProGen2 настроили на работу с CRISPR-Cas Atlas и с ее помощью сгенерировали 4 млн последовательностей, сбалансированных по семействам белков и размеру кластеров (на это ушло три дня с использованием 16 графических процессоров). Их распределили по типам CRISPR-Cas и отсеяли заведомо нефункциональные варианты.
Наилучший из них — PF-CAS-182. Его последовательность совпадала с SpCas9 почти на 72%. Этот белок назвали OpenCRISPR-1 и выложили его последовательность в открытый доступ. Более того, OpenCRISPR-1 совместили со сгенерированными языковой моделью адениндеаминазами и получили функциональную систему редактирования азотистых оснований, эффективно заменяющую аденин на гуанин в заданных участках ДНК. Все прошло успешно.
Источник: https://t.me/futurecap/6931
Источник изображения: https://t.me/futurecap/6931
Источник изображения: https://t.me/futurecap/6931
#ОбразованиеПресс
#НовостиОбразования
#ВысшееОбразование
#Исследования
#Технологии
#Инновации
#ИИ
#ДНК
#НовостиОбразования
#ВысшееОбразование
#Исследования
#Технологии
#Инновации
#ИИ
#ДНК
